Hey,
1) der Copter (zumindest der frühere Quad), ist etwas zu schwer. Weniger Gewicht kann Wunder wirken für eine längere Flugzeit.
2) auf welche Spannung hast du den LiPo Warner eingestellt? Die kommen oft serienmäßig mit 3,6V als Alarmlevel, da 3,7V aber die Nennspannung eines LiPos sind, können die 3,6V bei etwas mehr Gas schnell mal unterschritten werden (das macht dem Akku rein gar nichts, nur der LiPo Warner geht gleich an). Je nach dem wie weit du fliegt bzw. wie viel Vorwarnzeit du zum landen brauchst, stell den LiPo Warner mal auf 3,5 oder 3,4V, bei besseren Akkus (z.B. SLS, GensAce, Hacker TopFuel) kann man den Warner auch ohne Bedenken auf 3,3V stellen.
3) die Akku Kapazität ist für einen Hexa dieser Größe sehr klein, der kann ruhig größer sein. Wenn deine Akkus gleich alt, gleich viele Zyklen und natürlich die gleiche Kapazität haben, könntest du einmal 2 parallel schalten (macht 6000mAh Kapazität). Alternativ kannst du auch gleich einen neuen, stärkeren Akku kaufen.
4) Die Akkus sind für einen Hexa auch in der Belastbarkeit etwas klein, ein höheres C-Rating würde nicht schaden (oder eine höhere Kapazität).
5) eventuell überleg auch einen Umstieg auf 4S, dein Setup sollte es können.
6) Props machen auch einen wichtigen Teil aus, um effizient zu fliegen. Props mit niedrigerer Steigung laufen effizienter, also versuch eventuell mal 9x3,8" Props, damit wirst du zwar nicht ganz so viel Schub bekommen, dafür den Stromverbrauch senken (bzw. bei 4S einen 8x3,8" oder auch einen 9x3,8" Prop, muss man ausprobieren was da am besten läuft).
7) wen sich die Akkus aufblähen, wären neue vllt nicht schlecht. Schau dir mal die MultiStar High Capacity Akkus an, die haben bei gleichem Gewicht mehr Kapzität, dafür ein niedrigers C Rating (heißt: sie können nicht so hohe Ströme liefern, kein bolzen).
3S leider bis max. 5200mAh,
4S und 6600mAh sollten gut passen.